Antwort:
Fees sind Ertragsminderend und werden wieder vom Ertragskonto (3200) abgebucht. Wenn Du die genaue Zahlen separat in der Buchhaltung haben möchtest, zB. 3009 Erlösminderung.

Unsere Implementation:
Wir machen nicht pro Verkauf eine Buchung in Banana. Die Berücksichtigung von Refunds, Fees, Mwst, wäre sehr aufwendig.
PayPal bietet die Möglichkeit alle Transaktionen zu exportieren und diese kann man in Banana einlesen (es gibt ein Banana PayPal ac2 als Beispiel), von dem kriegt man nur Kopfweh, da man selber die Mehrwertsteuercodes pro Position für Verkauf/Refund/Fee/Chargebacks abfüllen muss. Produziert auch tonnenweise Daten in Banana. Nebenbei hat das Plugin ein Fehler und produziert komische Einträge wenn im Export ein / pro Zeile vorkommt.

Wir überführen die Erlöse aus PayPal monatlich in der Buchhaltung. Dazu verwenden wir die Monthly Statements von PayPal: Report / Statements / Monthly Statements. Diese kann man Requesten und nachher downloaden (MSR-202001.pdf).

Auf der zweite Seite befindet sich das "Activity Summary". Die Positionen werden wie folgt auf die dazugehörige Konten verbucht:

31.01.2020	PayPal-Q1	PayPal Payments Received CHF / Warenverkauf	1030	3200	1’500.00	CHF	1.000000	1’500.00	V77		-7.70	-107.24	
31.01.2020	PayPal-Q1	PayPal Payments Refund CHF / Warenverkauf	3200	1030	200.00	CHF	1.000000	200.00	-V77		7.70	14.30	
31.01.2020	PayPal-Q1	Withdrawal	1020	1030	1’000.00	CHF	1.000000	1’000.00					
31.01.2020	PayPal-Q1	Fees (paid)	3200	1030	75.00	CHF	1.000000	75.00	-V77		7.70	5.36	
31.01.2020	PayPal-Q1	Fees (returned)	1030	3200	10.00	CHF	1.000000	10.00	V77		-7.70	-0.71	
31.01.2020	PayPal-Q1	Chargeback (received)	1030	3200	300.00	CHF	1.000000	300.00	V77		-7.70	-21.45	
31.01.2020	PayPal-Q1	Chargeback (lost)	3200	1030	200.00	CHF	1.000000	200.00	-V77		7.70	14.30	

1030 ist das Buchhaltungskonto für PayPal in CHF, Anfangssaldo von PayPal setzen und monatlich kann das Saldo kontrolliert werden mit dem Report.
Fees sind Ertragsminderend und werden wieder vom Ertragskonto (3200, zweite Zeile im Beispiel) abgebucht, genauso wie Chargeback (Belastungen von Kunden die ein PayPal Dispute gewinnen/verlieren oder eine Kreditkartenrückbuchung machen/rückbuchen).

Wenn Mehrwertsteuerpflichtig müssen die Mehrwertsteuer-Codes (V77 inklusive %) und Vorzeichen für die jeweilige Buchungen beachtet werden.
Wenn mehrere Währungen in PayPal verwendet werden, für jedes ein Konto (1031 USD, 1032 EUR) erstellen.
Wenn du nebst Waren auch noch Dienstleistungen angeboten werden, müssen du die Beträge jeweils manuell auf 3200/3600 verteilt werden.
Bei Export Mehrwertsteuer-Code V0 verwenden.