Grüezi,
Ich denke, dass beide Methoden ihre Vor- und Nachteile haben. Es kommt drauf an, welche Tätigkeit deine Firma ausübt, ob sie ein Start-Up ist oder auf dem Markt schon lange besteht.
Die Saldosteuersatzmethode ist für diejenigen zu empfehlen, die ihren Verwaltungsaufwand reduzieren möchten, da die MwSt.-Abrechnungen semesterweise (also nur zweimal im Jahr) erfolgen. Der Steuersatz ist niedriger als bei der effektiven Methode, die Höhe des Steuersatzes hängt zwar von der Branche deines Unternehmens ab. Der Nachteil – du hast keinen Anspruch auf Vorsteuerabzug.
Es macht Sinn, sich für die effektive Methode zu entscheiden, wenn deine Firma ein Start-Up ist und die Investitionen in den ersten Jahren eher hoch sind, dabei rechnest du mit einem niedrigen bzw. keinem Umsatz in den ersten Jahren. Du kannst deinen Aufwand reduzieren, indem du die Vorsteuer vom Steueramt rückerstattet bekommst.